Jean-Henri Merle d'Aubigné (Les Eaux Vives, perto de Genebra, 16 de agosto de 1794 – Genebra, 21 de outubro de 1872) foi um ministro protestante suíço e um historiador da Reforma.

Os antepassados ​​de seu pai (Robert Merle d'Aubigné (1755-1799) foram franceses protestantes (refugiados). Jean-Henri estava destinado por seus pais a uma vida comercial, mas na faculdade decidiu ser ordenado. Ele foi profundamente influenciado por Robert Haldane, o missionário e pregador escocês que visitou Genebra e se tornou um dos líderes em Le Réveil.

Em 1817, ele foi para o exterior para aprofundar sua educação, quando a Alemanha estava prestes a comemorar o tricentenário da Reforma e, assim, ele concebeu a ambição de escrever a história dessa época.

Estudou na Universidade de Berlim por 8 meses, entre 1817 a 1818 e recebeu estímulo de professores diversos, como August Neander e Wilhelm Martin Leberecht de Wette.

Em 1818, d'Aubigné assumiu o cargo de pastor da igreja protestante francesa em Hamburgo, onde atuou por cinco anos. Em 1823, foi chamado para se tornar pastor da Igreja Protestante franco-alemã de Bruxelas, e pregador e para a corte de Guilherme I dos Países Baixos da Casa de Orange-Nassau.

Na revolução Belga de 1830, ele considerou oportuno realizar um trabalho pastoral em casa ao invés de aceitar um posto de ensino na família do rei holandês. A Sociedade Evangélica foi fundada com a ideia de promover o cristianismo evangélico em Genebra e em outros lugares, mas verificou-se que havia também necessidade de uma escola teológica para a formação de pastores. Em seu retorno à Suíça, d'Aubigné foi convidado para ser professor de história da igreja em uma instituição do tipo, e continuou a trabalhar na causa do protestantismo evangélico. Nele, a Aliança Evangélica encontrou um promotor entusiasta. Frequentemente visitava a Inglaterra, foi feito um D.C.L. (Doctor of Civil Law) da Universidade de Oxford, e recebeu homenagens cívicas da cidade de Edimburgo.

A primeira parte de sua História da Reforma, que foi dedicado ao período anterior do movimento na Alemanha, deu-lhe de vez um lugar de destaque entre os modernos historiadores franceses eclesiásticos, e foi traduzido para mais línguas europeias. A segunda parte, lidar com a reforma no tempo de exaustivamente tratada, mas não se encontrou com o mesmo sucesso. Faz parte do sujeito, com a qual ele era o mais competente para dizer, mas tudo foi concluído no momento da sua morte. Entre os tratados menores, os mais importantes são a reivindicação do caráter e objetivos de Oliver Cromwell, e o esboço das tendências da Igreja da Escócia.